62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1753 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  100 
 
 		 75 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  61.33 
 
 		 75 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  62.67 
 
 		 75 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  52.94 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  42.65 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  45.95 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  40.85 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  32.39 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  43.33 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  51.72 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1341  hypothetical protein  40.91 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.123342  hitchhiker  0.0000000187938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  50.98 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  50.98 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  44.59 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  41.54 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  40.38 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  48.28 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  39.71 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  43.94 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  44.9 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  40.38 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  38.67 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  42.03 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  46.55 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  37.14 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  38.24 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  33.8 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  31.37 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  34.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  37.29 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  25.35 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  45.83 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  32.86 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  42.65 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  44.83 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  52.08 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  35.94 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  59.46 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  38.82 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  30.38 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  40.74 
 
 		 102 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  39.06 
 
 		 88 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  38.75 
 
 		 110 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  31.43 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  45.76 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  25.35 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  41.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  38.03 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  35.82 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  43.48 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  45.1 
 
 		 95 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>