103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3569 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  72 
 
 
75 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  61.33 
 
 
75 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  42.65 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  42.65 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  42.25 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  41.89 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  45.07 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  41.43 
 
 
73 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  48.08 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  41.67 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  39.73 
 
 
73 aa  52  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  43.94 
 
 
89 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  45.45 
 
 
90 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  48.57 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  51.92 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  40.51 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  44.12 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  45.07 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  39.44 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  40.85 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  45.83 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  39.44 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  38.67 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  35.21 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  35.71 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  41.89 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  39.44 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  41.89 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  32.86 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  44.59 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  43.84 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  43.08 
 
 
102 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.28 
 
 
88 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  41.67 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  40.54 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  41.89 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  42.47 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  31.82 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  38.36 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  44.83 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  40.58 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  52.5 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1341  hypothetical protein  38.24 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.123342  hitchhiker  0.0000000187938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  37.84 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  37.1 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  35.14 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  35.21 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.39 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  35.62 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  31.08 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  35.21 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  37.84 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  30.56 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  37.14 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  44 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  44.83 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  35.21 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  41.3 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  30.99 
 
 
96 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  30.99 
 
 
96 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  43.75 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  37.84 
 
 
111 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  31.94 
 
 
90 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  36.23 
 
 
104 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  40.54 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  32.86 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  42.86 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  43.14 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  33.78 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  52.63 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  43.75 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  35.82 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  36.49 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  27.5 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  34.67 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  30.99 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  35.62 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  43.1 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  43.84 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  37.84 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>