42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0847 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  204  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  55.79 
 
 
105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  47 
 
 
106 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  51.72 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1603  hypothetical protein  40.21 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1971  hypothetical protein  35.79 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0309  hypothetical protein  39.18 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.942799 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1512  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.769481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1519  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0322495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1526  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0485  hypothetical protein  34.57 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0538  hypothetical protein  37.11 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.161352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0841  hypothetical protein  35.63 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  37.35 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0378  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  33.73 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  37.88 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  31.76 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  34.41 
 
 
94 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  29.55 
 
 
101 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  31.18 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  38.46 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  29.49 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  34.09 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  35.37 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  33.78 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  30.23 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  41.51 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  34.94 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  35.44 
 
 
107 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  30.85 
 
 
102 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  33.85 
 
 
90 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  34.69 
 
 
75 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  30.43 
 
 
98 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  37.74 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  37.7 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  33.75 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  32.58 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  37.74 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  38 
 
 
103 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>