33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0538 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0538  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.161352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0309  hypothetical protein  93.07 
 
 
101 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.942799 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1603  hypothetical protein  93.07 
 
 
101 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0378  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  142  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0841  hypothetical protein  57.43 
 
 
101 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  40.43 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0485  hypothetical protein  36.26 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1971  hypothetical protein  36.27 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  37.11 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  37.21 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  35.05 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  29.35 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  32.88 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  31.58 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  34.83 
 
 
96 aa  47  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.26 
 
 
94 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  23.91 
 
 
98 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  29.03 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  26.88 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1526  hypothetical protein  23.53 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1519  hypothetical protein  23.53 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0322495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1512  hypothetical protein  23.53 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.769481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  28.77 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  31.33 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  30.86 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  30.99 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  23.38 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  24.69 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  32.89 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  26.88 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  25 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>