93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1018 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  55.79 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  44.9 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1971  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0485  hypothetical protein  40.96 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1512  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.769481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1526  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1519  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0322495  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1603  hypothetical protein  36.96 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  42.19 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0309  hypothetical protein  35.87 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.942799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0841  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0538  hypothetical protein  37.21 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.161352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  37.08 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  36.08 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  35.58 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0378  hypothetical protein  32.61 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  37.84 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  35.9 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  33.72 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  40.35 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  44.26 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  37.84 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  37.97 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  37.76 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  39.51 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  33.85 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  29.21 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  47.92 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  37.88 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  47.92 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  42.31 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  32.53 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  29.89 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  32.47 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  45.83 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  34.57 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  28.72 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  35.53 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  28.74 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  42.11 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  32.89 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  38.18 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  29.49 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  29.63 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  35.14 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  46 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  33.77 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  32.91 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  52.5 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  35.37 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  38.78 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  36 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  33.93 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  29.07 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  36.73 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  34.12 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  37.29 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  30.21 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  43.4 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  40.82 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  48.15 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  40.82 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  28.92 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  36.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  37.74 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  36.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  36.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  36.73 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  28.4 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  34.29 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  34.21 
 
 		 91 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  28.4 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  37.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  28.4 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  40.74 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  31.4 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  38 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  34.21 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  40.54 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>