21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0485 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0485  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1971  hypothetical protein  50.55 
 
 
107 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1526  hypothetical protein  36.26 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1512  hypothetical protein  36.26 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.769481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1519  hypothetical protein  36.26 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0322495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  40.96 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  37.65 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  37.04 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0309  hypothetical protein  37.36 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.942799 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0538  hypothetical protein  36.26 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.161352  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  34.57 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1603  hypothetical protein  36.26 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0378  hypothetical protein  30.77 
 
 
101 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0841  hypothetical protein  30.11 
 
 
101 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  28.12 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  36.49 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  30.14 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  31.11 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  29.55 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  28 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>