95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1371 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  46.23 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  48.31 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  48.28 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  42.16 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  46.43 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  46.43 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  45.24 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  44.44 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  37 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  37.37 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  37.37 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  32.97 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  37.63 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  39.74 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  45.05 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  39.76 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  34.69 
 
 		 98 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  41.77 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  51.32 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  37.04 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  31.31 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  29.55 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  41.77 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  37.04 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  41.03 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  30.38 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  32.1 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  29 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  30.38 
 
 		 96 aa  47.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  40.54 
 
 		 84 aa  47.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  30.38 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  32.47 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  32.47 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  32.47 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  32.47 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  32.47 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  32.47 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  32.47 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  32.47 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  32.47 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  36.36 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  32.47 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  31.76 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  38.82 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  29.73 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  32.58 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  29.73 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  28.4 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  32.5 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  34.62 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  31 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  30.86 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  28.89 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.97 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  34.15 
 
 		 102 aa  43.5  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  29.47 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  36.23 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  30.38 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  37.84 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  28.95 
 
 		 99 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  32.18 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  30.39 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  26.83 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  24.42 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  32.43 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>