69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1715 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  100 
 
 		 101 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  96.04 
 
 		 101 aa  202  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  89.8 
 
 		 99 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  83.84 
 
 		 100 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  79.57 
 
 		 106 aa  157  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  76.4 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  67.71 
 
 		 114 aa  140  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  71.91 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0379  hypothetical protein  68.82 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3071  hypothetical protein  65.93 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0227257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  62.92 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  37.78 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  40.23 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  39.53 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  39.08 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  39.08 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  39.08 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  37.65 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  38.55 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  35.63 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  37.21 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  34.44 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  34.09 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  34.52 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  35.71 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  34.09 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  35.8 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  35.9 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  35.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  29.89 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  29.87 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  32.53 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  32.05 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  30.23 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05120  hypothetical protein  39.58 
 
 		 56 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0491  hypothetical protein  39.58 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  25.68 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  29.07 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>