165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2906 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2906  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3568  putative dienelactone hydrolase  55.25 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  32.74 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  35.34 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  35.55 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.35 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  27.62 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  33.94 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  27.63 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  29.74 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  35.34 
 
 		 407 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  37.4 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  34.25 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  27.68 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  27.4 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  32.73 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  35.38 
 
 		 413 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  34.62 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  33.83 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 		 433 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 		 420 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  38.98 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.9 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  28.83 
 
 		 408 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.87 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  30.18 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  30.07 
 
 		 410 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 409 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 409 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  35.51 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  25.26 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  31.69 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  24.45 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10371  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  27.04 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  28.37 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  29.93 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  24.12 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  30.15 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  25.77 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  24.77 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  30.39 
 
 		 290 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  24.34 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  24.31 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.6 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  21.88 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  29.61 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  24.03 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  23.5 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  25.47 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  24.11 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>