236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3568 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3568  putative dienelactone hydrolase  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2906  dienelactone hydrolase  55.25 
 
 
220 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  36.61 
 
 
223 aa  134  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  38.02 
 
 
191 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  35.85 
 
 
252 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  35.43 
 
 
222 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  36.75 
 
 
227 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  36.02 
 
 
229 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
229 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  34.05 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.33 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.9 
 
 
409 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  32.35 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
220 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.75 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  32.61 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  29.65 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.76 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  31.62 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
411 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  28.86 
 
 
410 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  32.82 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  25.89 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  28.31 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  32.82 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.89 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  38.21 
 
 
415 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  30.82 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  29.2 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.28 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.14 
 
 
413 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  29.47 
 
 
297 aa  68.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 
290 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
290 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  29.17 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  24.12 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  25.64 
 
 
275 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  24.43 
 
 
296 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  26.92 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  27.13 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.31 
 
 
271 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  28.12 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  27.88 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.31 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.75 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.67 
 
 
295 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  32.82 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  28.11 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.67 
 
 
295 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>