More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1605 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1605  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  463  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.82764  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1456  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.86 
 
 
358 aa  146  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  43.26 
 
 
356 aa  145  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  36.91 
 
 
271 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  35.58 
 
 
254 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  41.14 
 
 
366 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  38.86 
 
 
271 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
376 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
254 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
251 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  39.46 
 
 
266 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  36.36 
 
 
265 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  39.46 
 
 
393 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  35.1 
 
 
365 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.36 
 
 
370 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 
378 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  39.9 
 
 
365 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 
378 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  34.55 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  35.27 
 
 
333 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  38.22 
 
 
352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  35.68 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  39.55 
 
 
365 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.89 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  35.21 
 
 
368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  37.68 
 
 
370 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 
384 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3120  ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
348 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  34.76 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  38.71 
 
 
398 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 
334 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  33.62 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  37.2 
 
 
319 aa  132  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
426 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.62 
 
 
379 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  38.8 
 
 
380 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  37.85 
 
 
415 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  38.25 
 
 
239 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  37.14 
 
 
335 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  38.1 
 
 
365 aa  131  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  39.25 
 
 
365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  41.48 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  43.18 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  39.2 
 
 
363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  32.07 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 
386 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  38.66 
 
 
273 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2779  ABC transporter related  40.84 
 
 
257 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  39.46 
 
 
356 aa  129  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
365 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 
359 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  35.61 
 
 
364 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  33.49 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  32.93 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.33 
 
 
364 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  37.63 
 
 
388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.61 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  33.97 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  42.21 
 
 
345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.11 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  42.7 
 
 
368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  42.7 
 
 
363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
288 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  40 
 
 
356 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 
356 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.78 
 
 
378 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  39.46 
 
 
360 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  37.75 
 
 
356 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 
353 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  32.38 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
368 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
374 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 
356 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_002950  PG1380  ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0232406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  35.75 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  36.13 
 
 
364 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  36.81 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  36.07 
 
 
372 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  34.25 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5705  ABC transporter related  38.89 
 
 
366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  38.54 
 
 
381 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  34.65 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  39.13 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  31.33 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  35.19 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  38.83 
 
 
370 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1286  ABC transporter related  39.59 
 
 
324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
375 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3228  ABC transporter-related protein  41.29 
 
 
348 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>