More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1380 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1380  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0232406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2282  ABC transporter related  44.09 
 
 
271 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000447815  unclonable  0.000000000246868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  42.34 
 
 
248 aa  191  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0353  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2779  ABC transporter related  40.37 
 
 
257 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  42.01 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  40.54 
 
 
254 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
254 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.31 
 
 
272 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
272 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
254 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
272 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
229 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  40.61 
 
 
265 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
251 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  38.46 
 
 
271 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  40.81 
 
 
269 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
255 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  43.69 
 
 
297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  36.41 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
426 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  38.71 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  39.29 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  35.19 
 
 
251 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  40.74 
 
 
259 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.65 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  38.64 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  40.74 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  37.1 
 
 
457 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  40.47 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  41.26 
 
 
288 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  35.19 
 
 
251 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  41.74 
 
 
273 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  37.96 
 
 
267 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  39.74 
 
 
286 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 
251 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
251 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.27 
 
 
304 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  36.36 
 
 
304 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  38.99 
 
 
298 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  36.73 
 
 
457 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 
287 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  39.44 
 
 
271 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
434 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  40.09 
 
 
282 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  40 
 
 
267 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 
438 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.25 
 
 
283 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  39.34 
 
 
259 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  38.94 
 
 
448 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
271 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  40.93 
 
 
578 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
267 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  38.49 
 
 
259 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
264 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  38.97 
 
 
271 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  35.39 
 
 
307 aa  158  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  38.01 
 
 
257 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  37.72 
 
 
275 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
260 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  38.79 
 
 
259 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  40.27 
 
 
445 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  38.43 
 
 
286 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  36.82 
 
 
254 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  39.72 
 
 
301 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
267 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  40.19 
 
 
252 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  40.19 
 
 
252 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  39.63 
 
 
263 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
278 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  36.73 
 
 
271 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 
259 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  42.65 
 
 
264 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  37.27 
 
 
256 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  40.47 
 
 
278 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  39.15 
 
 
252 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
250 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
449 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  35.48 
 
 
276 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  37.05 
 
 
256 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
257 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  39.35 
 
 
436 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  41.43 
 
 
261 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
437 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  38.68 
 
 
283 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  40.82 
 
 
276 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  38.25 
 
 
308 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
275 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>