More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1642 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1642  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  775    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  71.5 
 
 		 378 aa  528  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1581  hypothetical protein  72.37 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000122912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  69.92 
 
 		 378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  29.95 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.32 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.31 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  22.43 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.54 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  21.1 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.8 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  20.95 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  28.23 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.76 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  27.32 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  29.24 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  28.09 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.58 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  22.89 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  22.03 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  23.01 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.77 
 
 		 858 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.36 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.4 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.94 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  25.66 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.28 
 
 		 857 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  28.4 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  21.46 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  24.26 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.76 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  28.95 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  23.15 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  26.24 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  20.83 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  20.95 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  28.95 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.56 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  31.29 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  22.91 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  21.69 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.34 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  29.56 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  22.26 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.34 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  21.12 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  23.32 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  21.55 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  20.58 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.17 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.11 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  25.64 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  21.16 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  22.56 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.51 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  32.24 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.06 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.64 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  23.91 
 
 		 668 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  23.91 
 
 		 668 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  23.48 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.66 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  29.3 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  23.43 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.53 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  20.33 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27.33 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  25.27 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.71 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.97 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.53 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.75 
 
 		 855 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  22.54 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  27.81 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  23 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>