More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1265 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1265  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.116043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  68.22 
 
 
249 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.137172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
240 aa  191  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.22369  normal  0.419134 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0788  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.48 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.596195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
258 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
254 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
254 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
250 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
248 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
248 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
258 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
368 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
254 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
280 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
255 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.45 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  29.53 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
286 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
285 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.61 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
288 aa  92  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
270 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
259 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
244 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
254 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
245 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.45 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.74 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.24 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
260 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
301 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  33.33 
 
 
260 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0816082  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
285 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.57 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0858  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
297 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  31.32 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
244 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  29.2 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
281 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  33.73 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
247 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.52 
 
 
259 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  31.47 
 
 
247 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
245 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
261 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
235 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>