115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2036 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 333 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  93.09 
 
 		 333 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  58.93 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  36.68 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  34.04 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  33.03 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  33.64 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  33.74 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  33.64 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  32.73 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  32.83 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  32.83 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  32.83 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  32.83 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  35.05 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  34.13 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  32.52 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  33.96 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  35.62 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  30.68 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  34.67 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  32.62 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  30.33 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  34.32 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  29.01 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  30.63 
 
 		 336 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  35.2 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  34.87 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  31.93 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  27.38 
 
 		 358 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  31.1 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  27.7 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  31.31 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  31.91 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  30.75 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  30.23 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.63 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  31.31 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  25.08 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  28.86 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  29.57 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  29.91 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.01 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  29.01 
 
 		 337 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  26.05 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  28.88 
 
 		 417 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  27.11 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  30.04 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  31.52 
 
 		 265 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  26.97 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  28.3 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  28.57 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  28.05 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  28.57 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  28.57 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  28.57 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  31.38 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  27.74 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  32.02 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  25.31 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  31.23 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  28.43 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  28.43 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  26.29 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  26.29 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  28.18 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  30.86 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  30.86 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  26.29 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  29.01 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  26.29 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  28.23 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  32.08 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  27.51 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  27.82 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  28.4 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  29.57 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  31.2 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24.76 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  27.02 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  24.34 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  28.08 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  26.62 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  29.69 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  27.76 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  28.74 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  26.88 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  29.05 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  28.03 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  34.72 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.04 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>