118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1355 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  100 
 
 
332 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  39.49 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  37.42 
 
 
333 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  36.68 
 
 
333 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  29.85 
 
 
324 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  30.82 
 
 
315 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  30.18 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  31.27 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  30.72 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  30.72 
 
 
332 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  29.25 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  30.09 
 
 
332 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  29.88 
 
 
332 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  30.72 
 
 
332 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  30.72 
 
 
332 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  28.06 
 
 
358 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  27.48 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  27.71 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  27.46 
 
 
332 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  26.15 
 
 
371 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  27.13 
 
 
332 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  31.6 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  27.01 
 
 
354 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  27.41 
 
 
328 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  26.51 
 
 
362 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  28.35 
 
 
336 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  27.58 
 
 
334 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  32.44 
 
 
265 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 
336 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  28.88 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.6 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  28.02 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  26.99 
 
 
339 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  25.79 
 
 
345 aa  95.9  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  26.1 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  32.21 
 
 
328 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  29.28 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  26.6 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  32.37 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  25.82 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  26.07 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  26.07 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  27.69 
 
 
292 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 
336 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  26.53 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  26.12 
 
 
325 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  28.99 
 
 
309 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  31.06 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  30.03 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  27.33 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  27.33 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  27.58 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  25.35 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  26.67 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  26.67 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  26.67 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  26.59 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  27.12 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  29.58 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  25.8 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  25.8 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  25.8 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  26.25 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  25.8 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  25.8 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  25.8 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  25.8 
 
 
416 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  28.19 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  29.85 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  25.85 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  24.86 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  24.57 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  24.57 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  24.91 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  24.07 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  27.36 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  24.93 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  23.12 
 
 
577 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  37.32 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  28.83 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  24.32 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  24 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  25.46 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  24.01 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  27.19 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  30.7 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  28.64 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  26.94 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  27.18 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  25 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  27.02 
 
 
281 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.9 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  26.84 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  24.07 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  28.76 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  26.61 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  32.77 
 
 
369 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  32.77 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  32.77 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  24.05 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>