79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4828 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  100 
 
 		 321 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  85.94 
 
 		 321 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  53.56 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  33.53 
 
 		 431 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  32.57 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  31.92 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  31.9 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  33.33 
 
 		 577 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  31.03 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  31.09 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  31.09 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  31.09 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  30.68 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  32.53 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  30.43 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  33.12 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  30.26 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  31.64 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  31.85 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  30.21 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  32.91 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  32.92 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  32.68 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  32.17 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  28 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  28.34 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  30.64 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  32.11 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  30.32 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  30.04 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  29.13 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  32.71 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  26.67 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  30.33 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  27.44 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  30.28 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  31.63 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  31.01 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  30.13 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  26.82 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  24.68 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  32 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  24.77 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  25 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  26.43 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  24.15 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  25.62 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  28.62 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  24.55 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  23.89 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  24.3 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  24.77 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  23.35 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  23.33 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  23.35 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  25.47 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  25.68 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  25.09 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  25.93 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  30.92 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  22.49 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  26.36 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  23.58 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  23.58 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  24.26 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  23.28 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  24.54 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  23.72 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  23.2 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.36 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2579  Type II secretory pathway component PulK-like protein  28.97 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0708012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  22.96 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  24.34 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  24.36 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>