53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0538 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 325 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  59.25 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  57.59 
 
 		 314 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  51.29 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  48.92 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  50.65 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  51.79 
 
 		 357 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  50.15 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  49.53 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  47.5 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  46.69 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  37.5 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  35.09 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  37.54 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  34.21 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  34.21 
 
 		 373 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  34.04 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  33.74 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  32.46 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  32.46 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  32.46 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  32.46 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  32.46 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  32.46 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  32.46 
 
 		 416 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  31.58 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  31.12 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  31.12 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  31.12 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  31.75 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  32.09 
 
 		 431 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  32.18 
 
 		 577 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  33.99 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  32.56 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  29.29 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  29.43 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  29.65 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  26.75 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  26.97 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  26.01 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.13 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.08 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.8 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  26.8 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  25.87 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  24.43 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  25.85 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  23.43 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  23.25 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  24.23 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  26.27 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  22.12 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>