105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0173 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 332 aa  687    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  96.08 
 
 		 332 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  96.39 
 
 		 332 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  96.99 
 
 		 332 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  90.96 
 
 		 332 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  90.66 
 
 		 332 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  90.96 
 
 		 332 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  90.36 
 
 		 332 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  91.19 
 
 		 334 aa  597  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  77.71 
 
 		 332 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  73.48 
 
 		 332 aa  524  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  72.39 
 
 		 362 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  71.69 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  70.15 
 
 		 324 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  73.94 
 
 		 333 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  72.48 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  37.31 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  34.36 
 
 		 371 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  34.64 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  39.04 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  37.61 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  35.56 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  37.12 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  37.61 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  38.18 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  33.14 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  32.21 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  34.18 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  34.13 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  35.98 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  35.31 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  35.31 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  35.67 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  29.62 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  33.44 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  29.73 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  33.18 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  33.18 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  33.18 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  30.09 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  31.3 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  31.3 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  32.73 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  30.41 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  32.83 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  29.19 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  33.03 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.67 
 
 		 320 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  26.4 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  30.23 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  28.66 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  29.09 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  27.38 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  24.06 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  24.06 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  26.98 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  27.08 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.06 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  26.05 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  26.09 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  26.24 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  25.73 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  25.57 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  25.97 
 
 		 577 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  25.27 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.51 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  23.86 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  23.86 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  23.86 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  23.86 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  24.07 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  23.6 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  23.39 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  27.21 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  23.91 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  23.91 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  37 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  25.14 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  23.62 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  24.85 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  37 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  27.48 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  25.3 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  24.77 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  25.65 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  24.55 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  25.47 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  24.16 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  23.68 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  24.06 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  24.44 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  23.88 
 
 		 375 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  24.16 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  23.85 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.47 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  19.05 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>