91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0601 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  93.29 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  49.84 
 
 		 301 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  44.73 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  44.52 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  39.3 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  29.23 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  27.08 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  26.46 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  29.26 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  29.58 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  28.4 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  27.24 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  27.83 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  31.54 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  28 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  32.95 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  26.88 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.86 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  25.1 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  34.34 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  32.46 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  36.07 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  27.63 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  26.38 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  23.38 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  23.91 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  26.38 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  26.38 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  26.38 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  31.71 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  25.38 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  21.93 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  25.38 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  26.84 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.36 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  23.29 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  25.76 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  22.81 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  21.13 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  23.48 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  24.84 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  25.08 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  25.94 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  24.16 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  25.97 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  26.56 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  24.53 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  23.64 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  34.15 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  24.46 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  24.7 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  23.58 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  24.84 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  24.84 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  26.5 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  24.16 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  34.82 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  34.82 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  34.82 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  34.82 
 
 		 372 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  34.82 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  34.82 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  34.82 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  24.18 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  35.45 
 
 		 417 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  31.97 
 
 		 431 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  23.7 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  23.7 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  23.7 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  22.96 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  24.31 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  27.64 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  24.23 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  24.23 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  37.04 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  22.84 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  24.56 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4121  hypothetical protein  34.31 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  23.62 
 
 		 362 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  37.97 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  38.46 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  37.97 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  32.89 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  37.97 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  37.97 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  37.97 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  30.56 
 
 		 352 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.7 
 
 		 545 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  33.33 
 
 		 577 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>