75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3525 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  100 
 
 
338 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  60.98 
 
 
315 aa  343  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  60.73 
 
 
381 aa  338  7e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  56.94 
 
 
357 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  59.68 
 
 
314 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  54.4 
 
 
343 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  52.32 
 
 
325 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  51.27 
 
 
333 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  47.02 
 
 
325 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  48.63 
 
 
332 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  48.21 
 
 
327 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  36.26 
 
 
416 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  36.26 
 
 
416 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  36.26 
 
 
416 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  36.26 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  36.26 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  34.71 
 
 
336 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  36.26 
 
 
416 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  36.26 
 
 
372 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  36.26 
 
 
417 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  34.73 
 
 
373 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  33.89 
 
 
373 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  34.44 
 
 
369 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  34.44 
 
 
369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  34.44 
 
 
369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  34.09 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  35.81 
 
 
337 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  33.53 
 
 
375 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  30.75 
 
 
577 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  31.03 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  33.53 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  31.91 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  32.93 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  31.58 
 
 
352 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  28.61 
 
 
332 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  29.13 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  28.66 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  31.53 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  29.66 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  28.39 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  28.3 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  28.05 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  27.84 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  28.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  27.3 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  27.62 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  25 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  23.72 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  24.21 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  25.22 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  25.28 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2579  Type II secretory pathway component PulK-like protein  26.34 
 
 
334 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0708012  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  24.02 
 
 
322 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  26.71 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  25.3 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  23.12 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  22.83 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  23.51 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  19.94 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  22.41 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  28.24 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  19.94 
 
 
332 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  19.94 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  19.88 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  21.7 
 
 
326 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  23.23 
 
 
339 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  20.76 
 
 
328 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  20.78 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  20.48 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  20.48 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  20.48 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  20.7 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  19.33 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  38.03 
 
 
240 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  22.8 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>