84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3944 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  88.45 
 
 		 577 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  100 
 
 		 431 aa  872    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  66.32 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  66.32 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  66.32 
 
 		 416 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  66.32 
 
 		 416 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  66.32 
 
 		 416 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  66.32 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  73.3 
 
 		 367 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  68.99 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  66.58 
 
 		 373 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  69.58 
 
 		 374 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  66.31 
 
 		 373 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  68.99 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  67.95 
 
 		 369 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  67.95 
 
 		 369 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  69.34 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  67.95 
 
 		 369 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  44.12 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  43.85 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  44.41 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  43.98 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  42.18 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  37.06 
 
 		 331 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  34.77 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  32.98 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  31.18 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  33.53 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  31.5 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  30.57 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  31.03 
 
 		 314 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  30.46 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  31.07 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  29.94 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  30.29 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  30.45 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  30.6 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.75 
 
 		 304 aa  99.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  39.47 
 
 		 325 aa  93.6  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.33 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  27.82 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  27.25 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  27.25 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  27.25 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  27.25 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  26.82 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  25.89 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  26.49 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  27.71 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  26.53 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  26.24 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25.91 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  26.69 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  29.03 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  24.93 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  25.57 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  24.02 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  24.04 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  24.92 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.15 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  23.47 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  27.82 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  24.43 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  25.32 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  23.51 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  28.22 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.08 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  21.53 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  24.24 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  23.82 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  23.29 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  22.89 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  36.71 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  24.91 
 
 		 272 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  27.2 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  24.9 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  57.14 
 
 		 658 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  28.67 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  31.97 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  31.65 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  42.86 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  41.94 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>