61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4244 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 318 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  28.79 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  28.76 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  29.41 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  31.94 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  31.34 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  29.94 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  28.2 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  27.45 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  28.87 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  27.71 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  28.96 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  26.59 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  27.86 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  27.86 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  27.86 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  27.57 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  28.71 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  26.71 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  28.31 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  28.31 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  28.31 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  27.57 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  27.57 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  29.26 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  30.1 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  24.17 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  27.88 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  26.44 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  24.24 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  25.24 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  24.85 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  28.83 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  27.62 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  28.33 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  26.88 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  25.66 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  29.67 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  29.67 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  29.33 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  29.67 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3309  hypothetical protein  25.31 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  24.41 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.61 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  29.67 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  32.2 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.09 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  28.39 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  29.63 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  25.5 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  27.89 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.94 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  27.89 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  26.91 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  25.91 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  26.61 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>