95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00608 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  100 
 
 
336 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  84.52 
 
 
336 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  63.69 
 
 
336 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  59.94 
 
 
339 aa  421  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  38.07 
 
 
326 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  36.2 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  39.74 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  42.32 
 
 
327 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  36.75 
 
 
332 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  36.89 
 
 
328 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  39.8 
 
 
325 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  39.46 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  39.46 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  39.46 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  35.56 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  35.87 
 
 
332 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  35.26 
 
 
332 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  36.36 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  34.74 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  35.89 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  35.56 
 
 
332 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  33.64 
 
 
332 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 
332 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  33.33 
 
 
332 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 
332 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  33.24 
 
 
345 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  32.78 
 
 
356 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  34.64 
 
 
358 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  34.95 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  37.31 
 
 
328 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  33.94 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  36.7 
 
 
328 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  28.53 
 
 
371 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  34.66 
 
 
325 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  29 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  33.55 
 
 
327 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  33.55 
 
 
327 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  33.22 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  33.22 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  33.22 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  36.2 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  32.42 
 
 
324 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  30.54 
 
 
333 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 
332 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  26.1 
 
 
354 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  29.24 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  30.24 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  27.21 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.54 
 
 
320 aa  89.4  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  27.76 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  27.88 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  27.88 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  28.88 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  31.25 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  26.44 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  25.83 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  23.84 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  23.53 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  26.22 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  22.39 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  25.3 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  24 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  27.35 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  24.67 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.32 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  22.73 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  21.83 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  24.41 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  26.73 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  23.6 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  23.39 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  23.72 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.52 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  25.93 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  24.32 
 
 
417 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  23 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  23 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  24.05 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  23 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  22.57 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  23 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  23 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  23 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  26 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  23.1 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 
373 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  26.85 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  23.33 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  25.26 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  23.32 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  23.33 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  25.71 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.38 
 
 
1708 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>