100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3573 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 354 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  34.13 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  35.41 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  32.14 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  30.57 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  30.15 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  29.82 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  29.77 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  31.47 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  29.48 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  30.92 
 
 		 324 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  31.9 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  28.9 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  29.48 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  29.48 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  31.38 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  28.95 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  29.19 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  29.82 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  29.45 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  29.53 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  26.22 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.01 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  30.58 
 
 		 333 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  26.1 
 
 		 336 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  26.79 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  27.56 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  26.81 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  26.1 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  31.72 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  27.35 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  26.76 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  26.29 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  28.41 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  28.88 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  25.25 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.57 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  29.03 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  27.16 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  29.57 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  28.48 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  27.83 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  28.53 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  28.16 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  28.16 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  29.29 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  28.35 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  28.35 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  28.35 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  27.95 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  27.95 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  30.9 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  28.51 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  28.41 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  26.84 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  26.05 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  26.4 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.9 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  24.59 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  34.21 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  24.59 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  29.75 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  24.33 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.11 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  24.34 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  24.82 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  22.73 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  22.73 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  22.12 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  21.53 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  24.44 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  22.91 
 
 		 417 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  25.62 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  25.62 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  25.2 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  25.62 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  25.62 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  25.62 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  25.07 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  25.98 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  22.28 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  40.3 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  22.01 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  22.01 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  31.06 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  40.3 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  24.47 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  30.43 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  30.43 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  34.29 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  24.41 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  32.86 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  28.15 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  24.54 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  22.05 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  24.22 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  22.25 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>