68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2536 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  100 
 
 
330 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  35.39 
 
 
362 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  36.31 
 
 
304 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  35.11 
 
 
362 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  35.74 
 
 
336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  34.29 
 
 
337 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  32.71 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.7 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  37.69 
 
 
352 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  31.21 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  34.29 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  30.93 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  31.46 
 
 
314 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  31.72 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  32.73 
 
 
332 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  30 
 
 
372 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  30 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  30 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  30 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  30 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  30 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  30 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  31.85 
 
 
369 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  31.25 
 
 
369 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  31.25 
 
 
369 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  30.99 
 
 
375 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  30.59 
 
 
417 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  28.01 
 
 
343 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  30.93 
 
 
373 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  30.49 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  28.57 
 
 
431 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  29.17 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  27.81 
 
 
577 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.16 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  31.95 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  29.46 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  31.95 
 
 
333 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  28.29 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.08 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  28.44 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.76 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  27.42 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  27.74 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  28.42 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  29.37 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24.24 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  25.93 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  23.81 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  24.55 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  23.73 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  24.35 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  24.47 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  22.87 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  25 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  26.65 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  25 
 
 
354 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  23.87 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  22.19 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  24.16 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  24.46 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  30.52 
 
 
292 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  23.42 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  24.21 
 
 
334 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  31.71 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  34.91 
 
 
328 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  25.48 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  25.07 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>