82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3048 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  100 
 
 		 362 aa  726    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  97.79 
 
 		 362 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  79.83 
 
 		 352 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  55.78 
 
 		 337 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  55.18 
 
 		 336 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  44.62 
 
 		 431 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  44.57 
 
 		 416 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  44.57 
 
 		 372 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  44.57 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  44.57 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  44.57 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  44.57 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  44.57 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  45.51 
 
 		 577 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  42.36 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  42.44 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  43.73 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  43.14 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  42.18 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  42.18 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  42.55 
 
 		 373 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  42.49 
 
 		 375 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  42.11 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  37.83 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  37.23 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  36.55 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  32.3 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  33.94 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  32.62 
 
 		 314 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  33.74 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  32.09 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  33.43 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.72 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  32.34 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  31.88 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  35 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  32.15 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  31.69 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  31.58 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  32.22 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  31.61 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  26.57 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  27.08 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  27.49 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  26.98 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.27 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  27.03 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  27.03 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  27.03 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.65 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  27.33 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  25.85 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.84 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  27.09 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  24.63 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.46 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  30.4 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  26.04 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  24.84 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  25.08 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  22.92 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  24.23 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  24.59 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  22.62 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  22.99 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  22.67 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  28 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  22.61 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  27.78 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  27.59 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  28.22 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  28.71 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  28.22 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  28.71 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  35.83 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  27.72 
 
 		 325 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  25 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  22.5 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  28.67 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  24.84 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>