102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3371 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  61.11 
 
 		 306 aa  377  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  42.67 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  40.89 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  39.3 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  41.31 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  32.02 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  32.99 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  27.16 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  30.03 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  28.27 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.06 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.67 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  29.64 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  29.86 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  32.64 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.15 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  28.82 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  29.78 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.64 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.2 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  28.88 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  27.95 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  28.57 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  31.34 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  30.59 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  26.5 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  26.38 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  32.14 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  28.32 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  32.52 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  24.22 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  26.5 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  24.67 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  22.3 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  28 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  24.09 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  29.93 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  28.76 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  28.95 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  27.8 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  25.81 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  24.84 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  29.83 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.87 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  29.83 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  24.44 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  22.49 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  24.01 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  24.6 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24.36 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  25.21 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  24.01 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  24.01 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  35.19 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  24.28 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  21.33 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  21.25 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  24.4 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  21.97 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  25.25 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  25.25 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  25.25 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  25.25 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  25.25 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  25.25 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  26.42 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  23.71 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  27.34 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  25.25 
 
 		 416 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  27.39 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  21.52 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  35.14 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  27.61 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  24.73 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  34.07 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  23.61 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  29.93 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  23.91 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  29.22 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  26 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  35.38 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  27.69 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  26 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  35.38 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  35.38 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  23.48 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  23.04 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  26.88 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  35.38 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  31.65 
 
 		 431 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  23.04 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  37.29 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  31.65 
 
 		 577 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  34.33 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  23.04 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>