39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3003 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  47 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  48.99 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  41.58 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  43.3 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  44.44 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  47.18 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.36 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  30.43 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  28.64 
 
 		 294 aa  89.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  25.95 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  26.58 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  26.58 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  32.75 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1589  hypothetical protein  26.03 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.699944  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  30.31 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  36.43 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  30.21 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  36.56 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  27.27 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  36.07 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  26.79 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  43.42 
 
 		 417 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  43.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  43.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  43.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  43.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  43.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  43.42 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  43.42 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2029  putative general secretion pathway protein K  29.29 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0345806  normal  0.0292856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  24.16 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  24.28 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  25.93 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  27.57 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  24.9 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  40.62 
 
 		 431 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  42.86 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>