28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3661 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  29.51 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  26.18 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  29.35 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  29.35 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  23.13 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  36.36 
 
 		 586 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  26.5 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  28.04 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  30.37 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  22.46 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  24.6 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  26.67 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  28.42 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  27.81 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  28.19 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  29.79 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  29.75 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  23.78 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  24.42 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  30.39 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  23.96 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  21.4 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  23.56 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.12 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  25.91 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  23.5 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  29.27 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>