25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0033 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  100 
 
 		 296 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  54.06 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  34.03 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  32.69 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  28.84 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  33.16 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.1 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  31.25 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  30.37 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.21 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  31.97 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  36.46 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  28.82 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  25.75 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  30.73 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  22.96 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  23.58 
 
 		 313 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  39.36 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  29.28 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  27.55 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  24.63 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  35.48 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  27.39 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3226  hypothetical protein  35.63 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000103936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  27.4 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>