50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0735 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  46.18 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  55.4 
 
 		 314 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  48.99 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  43.75 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  42.96 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  42.35 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  36.07 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.82 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  29.39 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  29.39 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  25.95 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  33.86 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  29.17 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  28.47 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1589  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.699944  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  31.73 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  34.81 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  28.32 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2029  putative general secretion pathway protein K  27.12 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0345806  normal  0.0292856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  32.8 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  27.46 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  26.52 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  28.23 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  24.52 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  28.32 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  28.32 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  28.32 
 
 		 416 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  28.32 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  28.32 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  28.32 
 
 		 416 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  28.32 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  28.85 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  31.67 
 
 		 417 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  34.33 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  42.86 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  28.34 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  42.86 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  42.86 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  26.1 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  25.6 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  47.62 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  45.45 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  47.62 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  35.56 
 
 		 577 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  42.11 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  37.08 
 
 		 431 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  40.3 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  24.9 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.19 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>