62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3024 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  27.43 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  28.44 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  28.44 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  27.15 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  30.31 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  26.42 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  27.64 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  26.22 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  36.11 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  25.36 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  33.08 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  40.79 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  25.21 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  37.5 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.18 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  31.71 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  22.62 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  25.51 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16110  hypothetical protein  23.87 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.939535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  35.38 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  33.72 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  24.11 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  24.49 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  29.51 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  23.18 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  26.37 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  30.6 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.78 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  23.66 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3226  hypothetical protein  25.23 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000103936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  33.98 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  25.78 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  23.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  23.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  23.32 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  40.58 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  23.57 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  22.97 
 
 		 586 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  22.42 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  40.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  40.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  40.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  40.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  40.58 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  40.58 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  41.94 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  22.27 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  22.42 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  31.53 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  22.17 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  22.17 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  28.89 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  21.83 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  28.89 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  28.89 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3248  hypothetical protein  26.7 
 
 		 749 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  30.68 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.66 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  27.19 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>