35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0916 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  100 
 
 		 293 aa  579  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  57.24 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  46.48 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  45.67 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  42.51 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  39.31 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  41.05 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1589  hypothetical protein  28.46 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.699944  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  29.39 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.33 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  30 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  29.68 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  28.95 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  30.88 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  27.89 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  34.27 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2029  putative general secretion pathway protein K  27.61 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0345806  normal  0.0292856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  28.02 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  31.58 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  30.26 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  27.64 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.51 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  25.41 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  29.38 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3756  hypothetical protein  29.85 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0935955  normal  0.283072 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4032  hypothetical protein  29.85 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  23.61 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  29.01 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1607  hypothetical protein  26.53 
 
 		 404 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  22.13 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3145  general secretion pathway protein K, putative  23.47 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.132735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  23.1 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  23.47 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0682  general secretory pathway protein K  36.54 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.0114744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>