21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3311 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  100 
 
 		 244 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3145  general secretion pathway protein K, putative  93.33 
 
 		 244 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.132735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  46.92 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  32.01 
 
 		 283 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  28.47 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  28.98 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  29.71 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  27.4 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  26.26 
 
 		 294 aa  72  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  28.52 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  29.31 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  27.88 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0682  general secretory pathway protein K  28.74 
 
 		 315 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.0114744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  26.9 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  22.18 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  34.55 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1589  hypothetical protein  29.36 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.699944  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2099  hypothetical protein  27.91 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165009  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1305  general secretory pathway protein K  26.44 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  24.51 
 
 		 313 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  27.34 
 
 		 304 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>