28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1284 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  100 
 
 		 314 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  54.01 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  47.55 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  41.05 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  46.94 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  41.13 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  37.67 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  35.09 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  30.63 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  30.88 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  31.25 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  30.77 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  29.33 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1589  hypothetical protein  33.13 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.699944  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  27.84 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  27.88 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  29.67 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  29.37 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  29.84 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  38.54 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  26.37 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  35.11 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2029  putative general secretion pathway protein K  30.36 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0345806  normal  0.0292856 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4032  hypothetical protein  25.25 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3756  hypothetical protein  25.25 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0935955  normal  0.283072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  24.47 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  31.76 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>