36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3639 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  100 
 
 		 586 aa  1191    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  30.52 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  27.67 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  29.58 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  30.29 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  27.52 
 
 		 306 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  24.27 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  36.36 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.29 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  25.25 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  29.75 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  25.84 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  32.29 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  36.19 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  36.19 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  44.62 
 
 		 358 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  25.91 
 
 		 321 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  25.91 
 
 		 321 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  27.46 
 
 		 321 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.56 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  29.11 
 
 		 287 aa  50.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  34.26 
 
 		 294 aa  50.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  26.29 
 
 		 321 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  30.21 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  26.96 
 
 		 271 aa  48.9  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  42.11 
 
 		 328 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  29.81 
 
 		 327 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  29.81 
 
 		 327 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  29.81 
 
 		 327 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  35.56 
 
 		 328 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  40.35 
 
 		 328 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  28.85 
 
 		 327 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  28.85 
 
 		 327 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  22.97 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  25.76 
 
 		 362 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  23.68 
 
 		 357 aa  43.9  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>