99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0104 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 327 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  35.89 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  36.5 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  38.11 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  38.44 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  37.46 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  39.04 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  39.57 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  37.46 
 
 		 332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  37.46 
 
 		 332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  39.04 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  39.04 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  35.98 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  38.7 
 
 		 332 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  37.12 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  40.34 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  42.32 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  38.2 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  35.56 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  39.12 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  36.39 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  39.23 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  38.93 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  38.93 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  38.93 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  31.72 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  30.03 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  31.52 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  35.74 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  35.44 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  31.16 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  33.11 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  28.77 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  29.32 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  34.57 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  34.57 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  34.57 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  34.57 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  34.57 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  36.06 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.48 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  33.19 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  26.81 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  27.23 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  28.11 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  28.04 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  31.67 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  25.08 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.37 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  28.79 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.62 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  28.79 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  27.19 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  25.43 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  22.9 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  26.62 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.36 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  24.36 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  28.25 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  26.44 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  21.92 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  21.92 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  21.92 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  21.92 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  21.92 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  21.92 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  22.22 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  21.87 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  26.91 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  23.17 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  20.38 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  23.4 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  23.36 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  23.49 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  21.05 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  21.38 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  23.79 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  23.81 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  21.66 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  21.38 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  23.47 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  21.12 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  21.12 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  21.45 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  23.43 
 
 		 362 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  20.38 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  21.33 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  25.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  22.39 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  27.67 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  23.47 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.78 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  26.34 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  20.48 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  22.3 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  31.65 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  30.38 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>