84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3178 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  54.49 
 
 		 321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  53.56 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  32.44 
 
 		 373 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  32.44 
 
 		 373 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  31.93 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  31.67 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  34.89 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  31.67 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  31.67 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  30.95 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  31.66 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  30.29 
 
 		 431 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  28.78 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  29.45 
 
 		 577 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  29.51 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  28.94 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  30.23 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  26.81 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  26.75 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  28.21 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  28.13 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  27.04 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  28.16 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  27.47 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  27.53 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  27.41 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  27.41 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  25.6 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  26.4 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  24.19 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  26.32 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  24.77 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  23.79 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  27.27 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  26.75 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.63 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.25 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  26.14 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  26.73 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  24.6 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  25.53 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  26.9 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.71 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.27 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  27 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  25.45 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  27.3 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  26.63 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  24.78 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  25.93 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  27.27 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  26.51 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  24.1 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  24.69 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  23.95 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  23.37 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  23.37 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  23.37 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  23.37 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  25.5 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  24.41 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  23.49 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  30.61 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  25.38 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  26.07 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  26.05 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  31.71 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  22.39 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  26.11 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  23.97 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  26.87 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  24.53 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.64 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  22.95 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>