80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4493 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  88.45 
 
 
431 aa  769    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  100 
 
 
577 aa  1171    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  72.16 
 
 
367 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  64.42 
 
 
416 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  64.42 
 
 
416 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  64.42 
 
 
416 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  64.42 
 
 
416 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  67.8 
 
 
372 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  67.8 
 
 
416 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  67.8 
 
 
416 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  67.89 
 
 
373 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  65.43 
 
 
373 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  67.61 
 
 
374 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  66.67 
 
 
369 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  68.08 
 
 
417 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  66.67 
 
 
369 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  66.67 
 
 
369 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  68.48 
 
 
375 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  44.94 
 
 
362 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  42.78 
 
 
336 aa  250  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  44.26 
 
 
337 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  44.38 
 
 
362 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  42.01 
 
 
352 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  38.05 
 
 
331 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  33.43 
 
 
327 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  32.85 
 
 
332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  31.87 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  31.07 
 
 
333 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  33.33 
 
 
321 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  32.27 
 
 
314 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  31.36 
 
 
321 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  29.92 
 
 
338 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  30.64 
 
 
357 aa  120  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  30.42 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  31.12 
 
 
381 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  31.14 
 
 
315 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  29.45 
 
 
317 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.56 
 
 
304 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.84 
 
 
320 aa  90.9  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  37.66 
 
 
325 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  26.2 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  25.81 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  25.81 
 
 
332 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  25.81 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  25.81 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  25.67 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  26.27 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25.28 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  25.67 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  26.82 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  24.72 
 
 
326 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  25.97 
 
 
332 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  23.12 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  28.52 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  25.93 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  27.78 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.59 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 
362 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.54 
 
 
333 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  23.28 
 
 
328 aa  63.5  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  24.63 
 
 
315 aa  63.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  24.16 
 
 
332 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0160  hypothetical protein  72.5 
 
 
86 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  23.51 
 
 
371 aa  61.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  23.9 
 
 
334 aa  57  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  35.71 
 
 
309 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  22.65 
 
 
334 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  22.12 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  23.44 
 
 
333 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 
272 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  22.05 
 
 
322 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  34.21 
 
 
306 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  24.52 
 
 
324 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  22.05 
 
 
322 aa  47  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  24.47 
 
 
328 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  40.62 
 
 
304 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  54.29 
 
 
658 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  21.65 
 
 
345 aa  43.9  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  31.65 
 
 
299 aa  43.5  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>