89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0055 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  86.17 
 
 
373 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  100 
 
 
374 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  86.4 
 
 
373 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  83.68 
 
 
369 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  83.42 
 
 
369 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  83.42 
 
 
369 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  85.15 
 
 
375 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  77.99 
 
 
416 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  77.99 
 
 
416 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  77.99 
 
 
416 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  77.99 
 
 
416 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  77.42 
 
 
372 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  80.17 
 
 
416 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  80.17 
 
 
416 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  77.41 
 
 
417 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  69.58 
 
 
431 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  67.61 
 
 
577 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  67.67 
 
 
367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  42.93 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  42.66 
 
 
336 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  42.39 
 
 
362 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  42.98 
 
 
337 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  44.17 
 
 
352 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  37.36 
 
 
327 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  34.24 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  33.91 
 
 
332 aa  166  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  37.17 
 
 
331 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  31.96 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  32.1 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  32.94 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.03 
 
 
321 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  30.95 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  31.44 
 
 
357 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  31.12 
 
 
381 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  30.84 
 
 
315 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  30.48 
 
 
304 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  39.47 
 
 
325 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  41.03 
 
 
333 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  26.72 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  25.78 
 
 
320 aa  87.4  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  45.54 
 
 
338 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  25.57 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  28.34 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  26.52 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  31.16 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  25.98 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  24.57 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25.79 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  26 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  26.46 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  25.44 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  25.92 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  22.95 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  25.15 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  24.32 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  23.6 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  35 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  22.83 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  23.28 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  23.28 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.4 
 
 
333 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  24.93 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  26.85 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  23.48 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  26.15 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  25.6 
 
 
309 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  21.66 
 
 
327 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  26.06 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.43 
 
 
345 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  41.54 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  25.81 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  24.19 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  26.06 
 
 
324 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  60 
 
 
658 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  27.86 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  34.07 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  47.62 
 
 
304 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  28.14 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  26.85 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  37.04 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  26.29 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  37.04 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  42.86 
 
 
313 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.142574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>