64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5693 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  100 
 
 
325 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  51.7 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  53.85 
 
 
315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  54.05 
 
 
314 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  53.77 
 
 
381 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  50.79 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  49.41 
 
 
357 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  47.28 
 
 
343 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  46.69 
 
 
325 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  46.6 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  46.75 
 
 
327 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  33.74 
 
 
336 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  32.87 
 
 
362 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  32.59 
 
 
362 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  32.1 
 
 
374 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  32.4 
 
 
416 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  32.87 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  31.58 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  32.19 
 
 
372 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  32.19 
 
 
416 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  32.19 
 
 
416 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  32.19 
 
 
416 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  32.19 
 
 
416 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  30.85 
 
 
369 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  30.85 
 
 
369 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  31.82 
 
 
373 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  31.13 
 
 
369 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  32.42 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  35.37 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  30.09 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  30.42 
 
 
577 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  32.92 
 
 
352 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  29.94 
 
 
431 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  30.79 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  33.33 
 
 
321 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.1 
 
 
321 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  30.56 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  28.19 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  25.46 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.94 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  26.3 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.85 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  27.51 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.9 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  26.32 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  27.76 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  24.63 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24.26 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  23.56 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  23.47 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  23.6 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  26.84 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2579  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.3 
 
 
334 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0708012  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  31.01 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  26.98 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  25.61 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  23.67 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  25 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  35.9 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  24.57 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  26.88 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  24.22 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  22.63 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>