24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2579 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2579  Type II secretory pathway component PulK-like protein  100 
 
 		 334 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0708012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  24.41 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  29.83 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  28.46 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  32.11 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  27.8 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  28.19 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  28.4 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  27.24 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  26.25 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  27.74 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  27.21 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  28.62 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  26.71 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  24.9 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  24.9 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  24.51 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  24.21 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  24.21 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  23.44 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  23.4 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  26.35 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>