52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0921 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  100 
 
 
357 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  61.4 
 
 
315 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  61.89 
 
 
381 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  56.94 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  57.1 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  54.86 
 
 
343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  51.29 
 
 
333 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  50.3 
 
 
325 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  49.71 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  49.72 
 
 
332 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  44.04 
 
 
327 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  34.63 
 
 
416 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  34.63 
 
 
416 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  34.63 
 
 
416 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  34.63 
 
 
416 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  34.63 
 
 
416 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  34.63 
 
 
372 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  34.63 
 
 
416 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  33.43 
 
 
336 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  33.61 
 
 
417 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  33.88 
 
 
369 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  33.88 
 
 
369 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 
369 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  34.44 
 
 
373 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  33.8 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  32.01 
 
 
374 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  32.7 
 
 
362 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  31.88 
 
 
362 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  31.92 
 
 
431 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  30.95 
 
 
375 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  31.73 
 
 
577 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  33.71 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  31.87 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  33.57 
 
 
352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  30.45 
 
 
321 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.25 
 
 
321 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  28.37 
 
 
331 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  28.12 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  28.33 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  26.01 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  27.43 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.82 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  30.89 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  26.8 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  26.8 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  23.77 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2579  Type II secretory pathway component PulK-like protein  34.65 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0708012  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  21.7 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  24.63 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  20.68 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>