47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2214 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  100 
 
 
301 aa  591  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  35.67 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  32.5 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  34.89 
 
 
317 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  30.82 
 
 
336 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  30.38 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  26.98 
 
 
416 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  26.98 
 
 
416 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  26.72 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  26.72 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  26.72 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  26.72 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  26.72 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  26.72 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  26.4 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  26 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  25.48 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  26.92 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  26.8 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  26.16 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  25.93 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  26.6 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  25.35 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  25.35 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  25.35 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  25.57 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  28.16 
 
 
381 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  26.9 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  25.88 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  24.78 
 
 
375 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  27.2 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  28.92 
 
 
331 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  26.67 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  24.85 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  27.13 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  27.8 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  28 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  26.84 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  26.1 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  22.69 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  28.93 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  28.93 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  27.05 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  24.84 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  29.19 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24.43 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>