60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3423 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  100 
 
 		 327 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  54.18 
 
 		 332 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  48.2 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  47.88 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  46.71 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  44.88 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  43.57 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  46.75 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  44.84 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  45.6 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  43.43 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  37.22 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  37.22 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  37.22 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  37.22 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  37.22 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  37.22 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  37.22 
 
 		 416 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  37.54 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  37.54 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  37.32 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  36.44 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  36.44 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  36.44 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  37.36 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  39.55 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  35.76 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  39.1 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  34.77 
 
 		 431 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  37.73 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  37.73 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  33.43 
 
 		 577 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  35.92 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  37.17 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  30.91 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.46 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  32.48 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  31.91 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  26.81 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  30.91 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  30.23 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.13 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  29.84 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  29.67 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  28.83 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  23.15 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.9 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  25.88 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  23.15 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  27.5 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  28.29 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  24.49 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  23.75 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  20.67 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  24.15 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  22.39 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  19.88 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2579  Type II secretory pathway component PulK-like protein  26.71 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0708012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  22.05 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  30.08 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>