56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0760 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  100 
 
 
343 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  61.11 
 
 
314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  58.18 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  53.85 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  53.71 
 
 
357 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  55.23 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  55.59 
 
 
381 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  54.09 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  49.56 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  48.2 
 
 
327 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  47.28 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  36.71 
 
 
336 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  34.24 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  34.54 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  32.71 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  34.67 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  34.28 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  33.05 
 
 
416 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  33.05 
 
 
416 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  33.06 
 
 
416 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  33.05 
 
 
416 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  33.05 
 
 
416 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  33.14 
 
 
372 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  33.99 
 
 
369 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  33.99 
 
 
369 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  32.97 
 
 
417 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  33.72 
 
 
375 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  31.87 
 
 
577 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  32.29 
 
 
362 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  34.67 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  31.18 
 
 
431 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  31.52 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  31.93 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  35.01 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  30.43 
 
 
321 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  31.05 
 
 
331 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  26.91 
 
 
321 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  28.21 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  28.86 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.58 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  30.82 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  28.51 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.45 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  27.79 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  25.48 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.1 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.94 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  23.69 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  23.48 
 
 
322 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  28.11 
 
 
324 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  21.95 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  20.59 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  21.95 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  21.95 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  21.65 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  22.39 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>