52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0671 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  100 
 
 
381 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  98.73 
 
 
315 aa  614  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  60.96 
 
 
357 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  59.64 
 
 
338 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  56.43 
 
 
343 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  58.06 
 
 
314 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  53.66 
 
 
325 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  51.1 
 
 
325 aa  291  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  50.31 
 
 
333 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  50.93 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  45.96 
 
 
327 aa  248  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  37.42 
 
 
336 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  36.31 
 
 
337 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  32.12 
 
 
416 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  31.61 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  31.61 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  31.61 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  31.61 
 
 
416 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  31.25 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  32.42 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  32.51 
 
 
416 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  33.14 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  32.84 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  31.81 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  31.9 
 
 
369 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  31.9 
 
 
369 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  31.32 
 
 
369 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  31.56 
 
 
375 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  31.15 
 
 
431 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  31.2 
 
 
577 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  32.01 
 
 
362 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  31.44 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  30.35 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  29.66 
 
 
321 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  28.7 
 
 
321 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  29.91 
 
 
352 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  31.97 
 
 
331 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.93 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  27.96 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  28.01 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  28.01 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  26.99 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.33 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  25.51 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  27.38 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  25.51 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.46 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  22.9 
 
 
336 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  25 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  25.88 
 
 
322 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  28.63 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  20.8 
 
 
326 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>