78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2389 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  47.43 
 
 
272 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  37.04 
 
 
265 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  30.8 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  31.11 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  30.7 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  30.18 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.18 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  28.38 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  29.73 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  26.89 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  29.86 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  29.41 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  29.41 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  29.41 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  29.02 
 
 
332 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  29.15 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  27.35 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  29.15 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  27.31 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  27.63 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  28.5 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  27.78 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  27.68 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  29.52 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  34.58 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  34.72 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  26.24 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  29.44 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  29.52 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  25.69 
 
 
371 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  26.85 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  24.42 
 
 
327 aa  58.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  33.8 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  27.48 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  28.38 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  29.55 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  29.55 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  29.55 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  26.24 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  29.55 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  29.55 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  26.29 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  44.44 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.36 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  27.78 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  27.6 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  24.09 
 
 
361 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  27.96 
 
 
334 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  25.42 
 
 
328 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  28.76 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  24.58 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  26.64 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  29.41 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  26.64 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  28.87 
 
 
373 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  26.39 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  29.3 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  28.99 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  23.11 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  24.5 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  27.05 
 
 
416 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  28.81 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  28.81 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  27.05 
 
 
416 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  27.05 
 
 
416 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  26.09 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  27.05 
 
 
372 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  27.05 
 
 
416 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  25.68 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  28.8 
 
 
577 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  30.23 
 
 
431 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  29.46 
 
 
373 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  27.05 
 
 
416 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 
417 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  27.05 
 
 
416 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  29.46 
 
 
374 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>