More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61628 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61628  DNA-dependent ATPase MGS1 (Maintenance of genome stability protein 1) DNA-directed DNA polymerase ATPase  100 
 
 		 747 aa  1542    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.17782 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  47.69 
 
 		 528 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 		 441 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 		 443 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  42.44 
 
 		 432 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  44.79 
 
 		 440 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  45.73 
 
 		 435 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  43.34 
 
 		 445 aa  356  8.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.57 
 
 		 439 aa  356  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  43.71 
 
 		 457 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  45.22 
 
 		 447 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 505 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  41.83 
 
 		 435 aa  350  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  43.79 
 
 		 434 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 		 457 aa  347  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  44.55 
 
 		 445 aa  346  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.59 
 
 		 448 aa  346  8.999999999999999e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  42.56 
 
 		 485 aa  345  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  43.79 
 
 		 434 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  42.05 
 
 		 446 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 		 432 aa  337  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  40.93 
 
 		 423 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  40.72 
 
 		 447 aa  333  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  42.63 
 
 		 441 aa  332  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  41.53 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  41.5 
 
 		 447 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  43.32 
 
 		 441 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  43.32 
 
 		 450 aa  330  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  43.32 
 
 		 441 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  41.3 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  41.3 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  41.38 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  42.32 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 441 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 423 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  41.8 
 
 		 447 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 441 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  42.45 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  41.32 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  39.91 
 
 		 441 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 441 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  42.58 
 
 		 457 aa  324  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 		 433 aa  324  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  44.08 
 
 		 423 aa  324  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  42.4 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  42.21 
 
 		 441 aa  324  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  41 
 
 		 449 aa  324  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  40.77 
 
 		 437 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  42.63 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  41.28 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 420 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  40.82 
 
 		 442 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  41.67 
 
 		 425 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  43.26 
 
 		 437 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  41.74 
 
 		 444 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  42.34 
 
 		 427 aa  321  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  42.25 
 
 		 473 aa  321  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 425 aa  321  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  42.35 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  43.37 
 
 		 419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  41.06 
 
 		 440 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 		 437 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 		 437 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  41.65 
 
 		 437 aa  320  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  41.72 
 
 		 451 aa  320  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  40.56 
 
 		 459 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  41.53 
 
 		 440 aa  319  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  40.84 
 
 		 447 aa  318  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 		 440 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  41.27 
 
 		 426 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  42.72 
 
 		 425 aa  318  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  41.59 
 
 		 426 aa  317  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  42.93 
 
 		 451 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  40.74 
 
 		 435 aa  317  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  40.78 
 
 		 440 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 440 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  42.41 
 
 		 435 aa  316  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  40.83 
 
 		 444 aa  316  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  42 
 
 		 432 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  40.94 
 
 		 439 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  39.63 
 
 		 441 aa  314  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  41.73 
 
 		 439 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  43.25 
 
 		 441 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  39.95 
 
 		 454 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 443 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  41.93 
 
 		 432 aa  314  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  41.49 
 
 		 437 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  41.22 
 
 		 437 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  41.75 
 
 		 442 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  41.5 
 
 		 440 aa  313  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0658  AAA ATPase central domain protein  40.8 
 
 		 454 aa  313  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0721035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  41.26 
 
 		 459 aa  313  9e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  39.83 
 
 		 438 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  41.97 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  42.22 
 
 		 437 aa  312  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  41.57 
 
 		 436 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>